阿里云智能達(dá)摩院-新冠肺炎全基因組測(cè)序智能分析

解決方案及特色

基因組檢測(cè)需要做到快速準(zhǔn)確，對(duì)海量測(cè)序數(shù)據(jù)做到快速分析需要強(qiáng)大的計(jì)算和存儲(chǔ)系統(tǒng)。依托阿里云強(qiáng)大的云平臺(tái)，支持線上和本地化大數(shù)據(jù)套件部署。
基因組數(shù)據(jù)分析方面，主要提供并行、分布式的大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。功能包括序列質(zhì)控、序列比對(duì)、序列拼接。每個(gè)步驟經(jīng)過(guò)優(yōu)化設(shè)計(jì)和參數(shù)調(diào)優(yōu)使得對(duì)于 CPU 和內(nèi)存的利用更為高效，從而有效減少了數(shù)據(jù)分析的時(shí)間。此外，系統(tǒng)提供友好界面，并支持一鍵出分析報(bào)告功能。
除了病原體檢測(cè)之外，對(duì)于不同來(lái)源病原體的序列和結(jié)構(gòu)分析有助于實(shí)現(xiàn)病原體的朔源和對(duì)應(yīng)藥物分析。進(jìn)化分析以及基于深度學(xué)習(xí)的人工智能算法能夠加速并且精準(zhǔn)實(shí)現(xiàn)預(yù)期目的。
系統(tǒng)采用云架構(gòu)，支持線上和用戶本地部署。配合阿里云專有云的 Iaas 和 Paas 系統(tǒng)，快速搭建大數(shù)據(jù)平臺(tái)。該平臺(tái)采用分布式存儲(chǔ)和分布式計(jì)算系統(tǒng)，有效解決基因測(cè)序數(shù)據(jù)量大，分析計(jì)算需要分布式或并行方式的特點(diǎn)�；�于該大數(shù)據(jù)平臺(tái)，分析速度能有效提升 4~10 倍，人工智能分析處理速度也大幅提升。

應(yīng)用與效果

全基因組測(cè)序技術(shù)在全國(guó)進(jìn)行應(yīng)用實(shí)踐。阿里達(dá)摩院在浙江省疾控中心和武漢金銀潭醫(yī)院做試點(diǎn)應(yīng)用，效果不錯(cuò)，整體準(zhǔn)確率非常高。